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中医对南瓜的利用主要集中在南瓜子，南瓜子有很好的驱虫作用，古代将其作为驱虫药和杀虫药使用。如果孩子或大人患有蛲虫病或蛔虫病，可以把南瓜子炒熟炒香，在早餐前空腹细嚼，既是食品又有很好的治疗效果。现代研究表明，南瓜子含南瓜子氨酸为驱虫有效成分，其乙醇提取物对血吸虫幼虫有抑制和杀灭作用，小鼠感染血吸虫尾蚴后每日灌服南瓜子1至3克连续28天，能显著降低血吸虫童虫成长率，减虫率达85.3%至95.7%，剂量愈大疗效愈佳。南瓜子仁富含锌元素和不饱和脂肪酸，锌有助于促进生长发育、提高免疫力，丰富的磷脂可滋养大脑，对男性前列腺也有保护作用。其杀虫而不伤正气，药性平和无刺激性，特别适合老人、小孩及体质虚弱者驱绦虫、蛔虫之用。
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